為配合近年政府極力推廣的STEM教育及促進兩地學生的STEM學術交流，深圳市第二高級中學、香港宣道會陳朱素華紀念中學、香港粉嶺救恩書院和香港聖公會何明華會督中學於2019年5月11日開展開了為期兩個週未共五天的第三屆深港創客馬拉松。

經過第一個週未的活動，來自九所共100名學生隨機分成20組，學生不但認識了物聯網（IoT）這技術，也學習了mPython程式編寫平台、掌控板及其他的傳感器的應用。在香港理工大學的研究人員帶領下，學生也有機會參觀理工大學各個實驗室。

而第二個週未，三日兩夜的深圳站活動則以比賽準備為主。香港學生首先獲安排到深圳市大彊創新科技有限公司參觀及聆聽工作人員的講解。學生可以了解到市面上最新款的無人機及其技術。第二天，在開幕儀式後，學生約有二十四小時與組員於深圳市第二高級中學的創客教育研究中心完成其作品，並預備在最後一天向各評審介紹他們的作品。