雲端防毒軟體的最大優點，就是隨時進行實時更新程序，並自動從雲端下載最新的病毒定義檔案，並為使用者的電腦進行文件掃描，確認系統是否已被任何新病毒感染，從而省卻日常管理防病毒軟件的繁複程序。同時，很多人都誤以為應用雲端防毒軟體的大前題，就是使用者必須具有快速的寬帶連接，才能充分利用雲端應用來防毒及殺毒，而如果沒有互聯網連接的殺毒軟件將無法正常工作。但其實正確情況就是，就算使用者處於離線狀態，雲端防毒軟體依然會保護使用者的電腦系統的。

雲端的防毒軟體，提供自動監控、更新、保護企業內部的所有電腦，並可毋需伺服器作後勤管理，亦毋需長期刻意的軟體維護。同時可對PC、Mac和Android等多項裝置提供按不同程度的防禦，即使教師經常進行流動應用，都可預先攔截任何威脅進入電腦。同時，一些雲端防毒軟體更提供基本的網絡監測功能，例如可防止師生連上不當的網站，以及防止USB儲存裝置所造成的感染，並提供機密資料的鎖定功能。